Az 1367. szeptember 1-én, Pécsett alapított egyetem (studium generale) rövid, mindössze néhány évtizedes működése nem bővelkedik forrásokban. Létrehozása szervesen illeszkedik a közép-kelet-európai egyetemalapítások sorába. A IV. Károly német-római császár (1346–1378) által életre hívott prágai egyetemet (1348) követő alapítási hullám idején szinte azonos időben jött létre a krakkói (1364), a bécsi (1365), végül pedig a pécsi studium generale.
Az 1967-ben kezdődött Székesegyház körüli ásatások az Aranyos Mária-kápolnával együtt feltártak egy épületet a várfal és a Székesegyház között, amely a 11-14. század között a pécsi püspökök palotája volt. A Középkori Egyetem épületét rekonstruálták és számos korabeli lelet tekinthető meg az épületben. Nemcsak történelmi értéke kiemelkedő, hanem az a modern technika is, ahogyan bemutatják mindezt: az egész várost rekonstruálták és modellezték, a végeredményt pedig animációs filmek és interaktív alkalmazások segítségével tekinthetik meg a látogatók. 3D-ben jelennek meg a korabeli épületek, emberek, de még a növények is! Az interaktív fejlesztések mellett makettek és időkerék segít tájékozódni a régmúltban.